正确答案 ：D

解析

本题考查常识。 “一国两制”是“一个国家，两种制度”的简称，指的是在中华人民共和国境内，内地坚持社会主义制度作为整个国家的主体，同时允许台湾、香港、澳门保留资本主义制度。因此，深圳、珠海、厦门等经济特区与香港、澳门特别行政区的主要区别是社会制度不同。故本题答案为D。 A、B、C项：说法正确，但不是主要区别。